Fakultas Kehutanan dan Lingkungan Institut Pertanian Bogor mempunyai beberapa Program Study Doktor, terdiri dari : Program Study Doktor Departemen Manajemen HutanProgram Study Ilmu Pengelolaan Hutan (IPH) Program Study Doktor Departemen Hasil HutanProgram Study Ilmu dan Teknologi Hasil Hutan (THH) Program Study Doktor Departemen Konservasi Sumberdaya Hutan dan EkowisataProgram Study Konservasi Biodiversitas Tropika (KVT) dan Program Study Manajemen Ekowisata dan Jasa Lingkungan (MEJ) Program Study Doktor Departemen SilvikulturProgram Study Silvikultur Tropika (SVK) 2